Epipedobates machalilla est une espèce d'amphibiens de la famille des Dendrobatidae.
Son nom d'espèce lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, le parc national de Machalilla.
Les mâles mesurent de 14,4 à 16,0 mm et les femelles de 15,0 à 17,6 mm.
Cette espèce est endémique d'Équateur. Elle se rencontre dans les provinces de Manabí, d'El Oro de Los Ríos de Bolívar de Guayas et de Cañar de 10 à 515 m d'altitude dans la plaine pacifique.
