La volpe volante malese (Pteropus vampyrus Linnaeus, 1758) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, diffuso in Indocina, Indonesia e nell'Arcipelago delle Filippine.
Il pipistrello dal muso corto minore (Cynopterus brachyotis Müller, 1838) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, diffuso nell'Ecozona orientale.
Il pipistrello mattutino (Eonycteris spelaea Dobson, 1871) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, diffuso nell'Ecozona orientale.
Il pipistrello dalla lingua lunga minore (Macroglossus minimus Geoffroy, 1810) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, diffuso nella regione Indomalese e australasiana.
Il rossetto di Geoffroy (Rousettus amplexicaudatus Geoffroy, 1810) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, diffuso nella regione Indomalese e parte della regione australasiana.
Taphozous melanopogon (Temminck, 1841) è un pipistrello della famiglia degli Emballonuridi diffuso nel Subcontinente indiano e nell'Ecozona orientale.
Il Pipistrello dal muso corto indonesiano (Cynopterus titthaecheilus Temminck, 1825) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, diffuso in Indonesia.
Scotophilus kuhlii (Leach, 1821) è un pipistrello della famiglia dei Vespertilionidi diffuso nell'Ecozona orientale.
Hipposideros diadema (E.Geoffroy, 1813) è un pipistrello della famiglia degli Ipposideridi diffuso nell'Ecozona orientale e australasiana.
Pipistrellus tenuis (Temminck, 1840) è un pipistrello della famiglia dei Vespertilionidi diffuso nell'Ecozona orientale.
Il pipistrello dei bambù maggiore (Tylonycteris robustula Thomas, 1915) è un pipistrello della famiglia dei Vespertilionidi diffuso nel Subcontinente indiano e nell'Ecozona orientale.
Il pipistrello della frutta dal dorso nudo delle Molucche (Dobsonia moluccensis Quoy & Gaimard, 1830) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, endemico delle Isole Molucche.
La volpe volante grigia (Pteropus griseus Geoffroy, 1810) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, endemico delle Isole della Sonda orientali, di alcune isole a sud di Sulawesi e delle Isole Banda.
Miniopterus australis (Tomes, 1858) è un pipistrello della famiglia dei Miniotteridi diffuso nell'Ecozona orientale ed australasiana.
Il pipistrello della frutta dal dorso nudo occidentale (Dobsonia peroni Geoffroy, 1810) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, endemico delle Isole della Sonda.
Rhinolophus philippinensis (Waterhouse, 1843) è un pipistrello della famiglia dei Rinolofidi diffuso nell'Asia sud-orientale, Australia e Nuova Guinea.
Il Pipistrello dal muso corto della Sonda (Cynopterus nusatenggara Kitchener & Maharadatunkamsi, 1991) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, diffuso in Indonesia.
La volpe volante di Lombok (Pteropus lombocensis Dobson, 1878) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, endemico delle Isole della Sonda, Indonesia.
Hipposideros bicolor (Temminck, 1834) è un pipistrello della famiglia degli Ipposideridi diffuso nell'Ecozona orientale.
Nyctimene keasti (Kitchener, 1993) è un pipistrello appartenente alla famiglia degli Pteropodidi, endemico delle Isole della Sonda e delle Isole Molucche.
Rhinolophus montanus (Goodwin, 1979) è un Pipistrello della famiglia dei Rinolofidi endemico dell'isola di Timor.
Scotophilus collinus (Sody, 1936) è un pipistrello della famiglia dei Vespertilionidi diffuso nell'Ecozona orientale.
Rhinolophus keyensis (Peters, 1871) è un Pipistrello della famiglia dei Rinolofidi diffuso in Indonesia.
Taphozous achates (Thomas, 1915) è un pipistrello della famiglia degli Emballonuridi diffuso in Indonesia.
Miniopterus paululus (Hollister, 1913) è un pipistrello della famiglia dei Miniotteridi diffuso nell'Ecozona orientale.
Miniopterus shortridgei (Laurie & Hill, 1957) è un pipistrello della famiglia dei Miniotteridi diffuso in Indonesia.
