Miniopterus aelleni (Goodman & al., 2009) è un pipistrello della famiglia dei Miniotteridi endemico del Madagascar e delle Isole Comore.
Pipistrello di piccole dimensioni, con una lunghezza totale tra 88 e 95 mm, l'avambraccio è lungo tra i 35 e i 41 mm, la coda tra i 40 e i 45 mm, il piede tra i 5 e i 7 mm e le orecchie tra i 10 e i 12 mm. Il Miniopterus aelleni arriva ad un peso di 6,5 g.
Le parti dorsali variano dal marrone al marrone scuro, con la testa talvolta più chiara, mentre le parti ventrali sono brizzolate, dovuto alla punta giallo-brunastra dei peli. La fronte è molto alta, il muso è stretto e con le narici molto piccole. Le orecchie sono corte, triangolari e con l'estremità arrotondata. Il trago è lungo, largo alla base, con una flangia laterale e che diviene affusolato e piegato in avanti verso l'estremità smussata. Le membrane alari sono marroni o marroni scure e attaccate posteriormente lungo le anche. La coda è molto lunga ed inclusa completamente nell'ampio uropatagio, il quale è cosparso di piccoli peli.
Questa specie è endemica del Madagascar settentrionale ed orientale e dell'isola di Anjouan, nelle Isole Comore.
Vive nelle foreste decidue secche fino a 1.100 metri di altitudine.
Si rifugia probabilmente all'interno di grotte calcaree.
Si nutre di insetti.
