에콰도르볼로쥐는 볼로쥐속에서 중간 크기의 종으로 꼬리 길이 약 70mm를 포함하여 전체 몸길이가 200mm까지 자란다. 털은 짧고 거칠다. 등 쪽 털은 주로 검은색이고, 털 일부는 뺨 위에 회색과 노란색 줄무늬로 나타나며, 목 옆 쪽과 몸은 약간 올리브색을 띤다. 배 쪽은 희끄무레하고 귀는 갈색이며 털이 잘 발달해 있으며, 꼬리는 윗면이 짙고 아랫면은 연한 색으로 두 가지 색을 띤다. 손과 발등은 갈색과 흰색이고 다른 발가락에 비해 다섯번째 발가락이 상당히 작다.
