Filipinomysz krótkoogonowa (Apomys banahao) – gatunek ssaka z podrodziny myszy (Murinae) w obrębie rodziny myszowatych (Muridae), występujący endemicznie w prowincji Quezon na Filipinach w wysokich partiach góry Banahaw.
Długość ciała (bez ogona) 125–154 mm, długość ogona 111–133 mm, długość ucha samic 22–24 mm, długość tylnej stopy 33–37 mm; masa ciała 71–92 g. Filipinomysz krótkoogonowa wykazuje znaczne podobieństwo do filipinomyszy jasnej. Należy do mniejszych gatunków z podrodzaju Megapomys. Jest gryzoniem małej wielkości. Futro w części grzbietowej jest gęste, miękkie i długie o wybarwieniu ciemnobrązowym z nieco jaśniejszym odcieniem na bokach. W części brzusznej futro jest prawie białe.
Filipinomysz krótkoogonowa jest znany tylko z góry Banahaw i sąsiedniej góry Banahaw de Lucban, na wyspie Luzon, należącej do Filipin; prawdopodobnie występuje również na sąsiedniej górze San Cristobal.
