Vitkronad manakin placeras som enda art i släktet Pseudopipra. Den delas upp i tretton underarter med följande utbredning:
Tidigare placerades den i släktet Dixiphia.
Arten har ett stort utbredningsområde, men tros minska i antal, dock inte tillräckligt kraftigt för att den ska betraktas som hotad. Internationella naturvårdsunionen IUCN listar arten som livskraftig (LC).