Esta especie se diferencia de todas las demás de Rhinoclemmys en su gran tamaño adulto (longitud de caparazón estimada entre 38 y 41 cm); caparazón y plastrón alargado; dorso del caparazón liso y acarinado. Rhinoclemmys panamaensis es el miembro más grande conocido del género y es morfológicamente más similar a la existente R. funerea.