Siagonodon cupinensis est une espèce de serpents de la famille des Leptotyphlopidae.
Son nom d'espèce, composé de cupin et du suffixe latin -ensis, « qui vit dans, qui habite », lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, le Cupin, un ruisseau situé dans le bassin du Rio Tapirape au Mato Grosso au Brésil.