Aphanius transgrediens est une espèce de poissons de la famille des Cyprinodontidae.
Son épithète spécifique, du latin transgrediens, « intermédiaire », lui a été donné en référence à ses caractéristiques comprises entre les genres Aphanius et Anatolichthys.
Aphanius transgrediens peut mesurer jusqu'à 54 mm de longueur totale et son poids maximal enregistré est de 2,44 g. Il s'agit d'une espèce non-migratrice qui tolère une plage de températures allant de 16 à 24 °C. Son maintien en aquarium est extrêmement difficile.
Aphanius transgrediens est endémique du bassin versant du lac Acıgöl à l'ouest des monts Taurus en Turquie. Il fait partie de la liste des 100 espèces les plus menacées au monde établie par l'UICN en 2012.