Hipposideros pygmaeus is een vleermuis uit het geslacht Hipposideros die voorkomt in de Filipijnen. Deze soort is gevonden op de eilanden Bohol, Luzon, Marinduque, Negros en Panay. Er zijn slechts weinig exemplaren bekend; die zijn gevangen in grotten in of bij regenwoud, tot op 200 m hoogte. Het is een zeldzame soort. H. pygmaeus behoort tot de H. bicolor-groep.
