Svartkronad järnsparv är en liten sparvliknande fågel med tunn näbb, med kroppslängden 13–14 centimeter i storlek med järnsparven (Prunella modularis). Dräkten är mest lik sibirisk järnsparv (Prunella montanella) med mörka kinder, mörk hjässa, brett vitt ögonbrynsstreck och undersidan varmbeige. Ögonbrynsstrecket är dock smutsvitt och inte gulbeige, ovansidan kallt brun istället för varmbrun samt att undersidan snarare är orangetonad koncentrerad till bröstet.
Arten är en livlig fågel som rastlöst kilar på marken eller flyger mellan låga buskar. Sången är en silverklar strof.
Arten förekommer som stannfågel eller höjdledsflyttare i bergstrakter i Turkiet, Armenien, norra Georgien och Iran. Sedan 2016 inkluderar dock bland andra Birdlife International arten jemenjärnsparv (Prunella fagani) med utbredning på sydvästra Arabiska halvön som en underart på basis av liknande utseende, läten och liten genetisk skillnad. Den behandlas som monotypisk, det vill säga att den inte delas in i några underarter.
Svartkronad järnsparv häckar i klippiga betesmarker med spriddsa berberisbuskar i Turkiet, i Kaukasus på klippiga bergssluttningar med låga enbuskar och ceder. Vintertid ses den även i buskmarker nära bergsbäckar. Dess häckningsbiologi är dåligt känd, men bon har hittats mellan juni och augusti med tre till fyra ägg.
Internationella naturvårdsunionen IUCN kategoriserar arten som livskraftig, men inkluderar även jemenjärnsparv i bedömningen. I Europa tros det häcka 11.000-33.200 par. Europa tros utgöra ungefär 55% av artens utbredningsområde, varför världspopulationen mycket preliminärt uppskattas till 40.200-120.900 individer.
