마다가스카르 큰머리 거북은 이름에서도 나오듯이 다른 거북에 비해 큰머리를 가진 것이 특징이다. 그것은 신체의 모든 부분을 둘러싸고 있는 어두운 갈색의 쉘을 가지고 있으며 갑피에 무늬와 갈래가 없다. 또한 알에서 깨어난지 얼마 안된 어린 거북이는 껍질에 미세하게 작은 검은색의 선을 가지고 있지만 자라면서 사라지게 된다. 또한 콧구멍이 앞쪽으로 쏠려 있으며 눈이 검은색을 띄고 있다. 먹이로는 수생 식물, 과일, 씨앗과 물고기와 곤충 등을 먹고 사는 잡식성의 거북이 된다.