Obecnie wyróżnia się trzy podgatunki P. ammodendri:
Proponowany podgatunek korejewi zsynonimizowany z podgatunkiem nominatywnym, a timidus (opisany z pustyni Gobi) – ze stoliczkae.
IUCN uznaje wróbla mongolskiego za gatunek najmniejszej troski (LC, Least Concern) nieprzerwanie od 1988 roku. Liczebność światowej populacji nie została oszacowana, ptak ten opisywany jest jako pospolity, lokalnie pospolity lub bardzo liczny. Trend liczebności populacji uznawany jest za stabilny.
