Pärlhättemanakinen är en liten (9 cm) manakin i grönt och gult. Hanen är huvudsakligen bjärt gräsgrön med gult på buken och undre stjärttäckarna. På huvudet syns vitaktig hjässa och nacke, vitaktig näbb och gul ögoniris. Benen är ljusskära med gula "lår". Honan liknar hanen men har istället grön hjässa och nacke. Hanens läte är ett snabbt upprepat "chi-wir".
Pärlhättemanakin delas in i två underarter med följande utbredning:
