Svartstrupig siska är en liten streckad, gråbrun fink med citrongul övergump och vita stjärtspetsar. Strupen är svart i varierande mängd, mer utbrett hos hanen än honan. Sången är komplex, en serie med visslingar och melodier. Lätena är enklare, melodiska en- eller tvåtoniga "soooe-sweee".
Svartstrupig siska delas in i sju underarter med följande utbredning:
Underarten seshekeensis inkluderas ofta i semideserti. Tillfälligt har den setts i Spanien, men den anses osannolikt att den nått dit på naturlig väg.
Svartstrupig siska hittas i törnbuskmarker, skogslandskap, buskiga områden i höglänta gräsmarker, odlingsbygd och trädgårdar. Där ses den i par eller flockar, födosökande på marken, i småbuskar och i gräs.
Arten har ett stort utbredningsområde och en stor population med stabil utveckling och tros inte vara utsatt för något substantiellt hot. Utifrån dessa kriterier kategoriserar internationella naturvårdsunionen IUCN arten som livskraftig (LC).