Dvärgfruktduva (Ptilinopus nainus) är en fågel i familjen duvor inom ordningen duvfåglar.
Dvärgfruktduvan är som namnet avslöjar en mycket liten fruktduva. Fjäderdräkten är huvudakligen grön med lysande gult på undergumpen. Hanen har en tydlig lilafärgad teckning över bröstet och en ljus halvmåne över skuldran. Arten liknar hona rödstrupig fruktduva och vitbandad fruktduva, men är mindre med gula kanter på vingpennorna. Lätet är ett tydligt fallande och sedan stigande "oh-wah!" som upprepas ett antal gånger.
Fågeln förekommer i låglänta områden på Nya Guinea förutom längst i nordväst och norra kusten av sydöstra delen av ön. Den hittas även i Raja Ampatöarna utanför nordvästra Nya Guinea. Den behandlas som monotypisk, det vill säga att den inte delas in i några underarter.
Dvärgfruktduvan hittas i regnskog i låglänta områden och förberg. Den ses ofta i par och ibland tillsammans med andra fruktduvor. Födan består av frukt och nektar.