자이언트두더지쥐는 연중 활동적이다. 땅을 파고 굴 속의 지하에서 주로 서식하며, 일자일웅 생활을 하는 것으로 추정된다. 12월과 1월 사이에 보통 번식을 하고, 암컷은 두 세 마리의 새끼를 낳는다. 뿌리와 덩이줄기를 갉아 먹기 위해 앞니를 사용할 뿐만 아니라 땅을 파는 데도 사용한다. 이빨은 날카롭고 기능적으로 유지하기 위해 계속해서 자라고 이빨 면을 갈 필요가 있다. 이는 턱을 주기적인 운동으로 올리거나 내리고 돌출시켜 윗니와 아랫니를 함께 갈아서 얻을 수 있다.
