마케도니아쥐(Mus macedonicus)는 쥐과 생쥐속에 속하는 설치류의 일종이다. 조지아 동부 지역부터 불가리아 서부와 이스라엘 지역까지 서식한다. 생쥐(M. musculus)와 스텝쥐(M. spicilegus), 알제리쥐(M. spretus)와 함께 전북구 개체군을 형성하는 3종으로 간주되었다.
마케도니아쥐는 몸무게 15g의 작은 설치류이다. 장소에 따라 털 색이 크게 차이가 난다. 터키의 수많은 표본에 대한 연구에서, 마케도니아쥐의 등 쪽 털은 짙은 갈색부터 밝고 연한 갈색과 검붉은 갈색까지 띤다. 옆구리를 따라서 등 쪽과 배 쪽 털 색이 분명하게 구분되는 선이 나타난다. 배 쪽은 희끄무레한 회색과 순백색, 누르스름한 흰색, 불그스레한 희색 등 다양하다. 귀에는 작고 흰 털이 나 있다. 꼬리 윗면은 짙은 갈색인 반면에 아랫면은 연한 색을 띤다. 발바닥은 털이 없는 반면에 발 윗 등은 흰 털이 나 있다. 야행성 동물이다.
