Myotis chiloensis, el murciélago orejas de ratón del sur, es una especie de murciélago miembro del género Myotis. Este género es el más variado de todos los mamíferos, con más de 90 especies.
Es un Myotis de tamaño mediano (unos 9 cm de envergadura alar), muy variable en color: desde rubio (para las porción norte de su distribución) hasta marrón oscuro (para la región sur); es el único representante del género en las dos terceras partes de la zona sur de Chile (La Val 1973). Su nombre proviene de la isla Grande de Chiloé, dado que la localidad tipo se halla en unos islotes del lado este de esta.
Es insectívoro, alimentándose principalmente de dípteros que atrapa al vuelo.A la fecha, ha sido una especie poco estudiada, faltando datos sobre su estado de conservación y hábitat.
