il cranio ha minori dimensioni, ma maggiore larghezza
gli zigomi sono molto ispessiti e presentano numerosi incavi; è inoltre presente una protuberanza in corrispondenza della sutura iugale-squamosale, assente nel facocero comune.
il facocero del deserto non ha incisivi, a differenza del facocero comune che ha due incisivi nella mascella e sei nella mandibola.
il terzo molare è molto largo e non presenta radice.
le fosse sferiche sul retro del cranio, nel facocero del deserto, sono molto più estese di quelle del facocero comune.
